北京大学医学部在职教育培训中心成立于2002年，系直属于北京大学医学部的二级教学单位。是经北京大学及北京市海淀区教育委员会批准注册的、专事在职人员非学历教育、继续教育的教学机构。

培训中心恪守“厚德 、博学、 济世、 尚善”的培训理念，遵守国家法律法规，弘扬北大教育精神，以成人教育和继续教育为途径，面向国内医药卫生行业高层管理人员及执业人员，以医药行业及卫生事业管理的新理念、新思想、新知识、新技术为主要培训内容，使学员及时了解和掌握本领域中国内外的现状及新信息，不断促进其知识和能力的更新、补充、拓展和提高，完善其知识结构，不断充实和提高学员的管理素质与执业能力。

北京大学医学部在职教育培训中心同国家各级教育和卫生行政管理机构的相关部门，具有多年的密切合作，经过多年的运作已形成跨省市的教育培训网络。依托北京大学雄厚的师资力量和教学研究机构的强大基础，及医学部近百年专事医疗卫生教育的丰富教学经验，在课程设置、师资力量、科研能力、教学组织、资源整合和项目合作等方面，已形成强大的资源优势。

目前北京大学医学部在职教育培训中心主要开展医疗卫生行业从业人员的继续教育和专业技能培训；医疗卫生行业管理人员及医药企业管理人员的 EMBA培训；医药卫生行业管理人员高级研讨会、论坛、高级峰会的组织；医药卫生行业管理人员的出国考察和学术交流的组织；医药卫生行业管理人员的俱乐部和沙龙的组织。在促进卫生行业高级管理人员掌握知识理论的同时，也搭建了卫生部门及其相关部门各层次管理者之间沟通、交流的平台。