中国少年科学院是共青团**、全国少工委于1999年2月创建的以6－16岁少年儿童为服务对象，以少年儿童校外教育阵地为依托，以鼓励少年儿童爱科学、学科学、讲科学、用科学，培养少年儿童的观察能力、动手能力和创新能力，提高科学素质，丰富活跃少年儿童课余生活为目标的工作机构。
团**、中国科学院和全国少工委领导历来关心重视中国少年科学院工作。原全国人大副委员长、中国科学院院长卢嘉锡曾任中国少年科学院名誉院长，原共青团**书记处常务书记、全国少工委主任赵勇担任**任院长，原共青团**书记处书记、全国少工委常务副主任张晓兰同志担任第二任院长，现任院长为团**书记处书记、全国少工委主任罗梅同志。同时聘请了路甬祥、杨乐、戚发轫等两院院士、著名科学家和科普教育成立了中国少年科学院指导委员会。
在共青团团**、全国少工委领导下，中国少年科学院是少先队系统开展少年儿童科技教育的唯一平台和载体，自中国少年科学院创建以来，陆续开展了“小院士”评选、“争当小实验家”，“走进美妙的数学花园”、“科技之星”读书、“手拉手”助学等系列活动，累计有上千万少年儿童积极参与，党和国家领导人曾多次出席中国少年科学院系列活动，接见了参与活动少年儿童代表。
在全国少工委主管领导下，秘书处设在北京中少创科文化传播有限公司，是中国少年科学院执行机构。
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