光绪三十三年（1907年），柯志仁劝募美国嫠妇柯琳·约翰逊女士（CaroleyJohnson）捐资，在本校现址建成**幢校舍（南洋楼），建筑面积973.6平方米。同年，学校更名为融美中学堂，寓玉融美以美会中学之意。

融美中学堂历十三届（1907-1923年）累计学生人数共1418人，平均每年在学约83人，多时（1910年）学生数曾达124人。牧师方鲍参，美国传教士力亨利（HenryVeezeLacy）、马尔庚（HughC.Moygan）等先后担任堂长。著名宗教界人士、原协和大学校长杨昌栋，著名的元史、蒙古史学家翁独健等，均在该时期就读于本校。

二十世纪20年代中期，随着中国革命形势的发展，收回教育权运动在全国范围展开。民国十四年（1925年），中国政府教育部公布《外人设立学校请求认可办法》。民国十五年（1926年）大学院公布《私立学校规程》等，规定教会学校“校长须为中国人”，“外国人**为董事长或董事会主席”。正是在这个背景下，融美中学堂于民国十三年（1924年）更名为融美初级中学，深受师生爱戴的薛永香先生始得于民国十五年（1926年）出任校长，民国十八年（1929年）学校向福建省教育厅申报立案。

本校校名以“融美”为冠共历45届，几近半个世纪，累计各年在学生人数共达7058人。它是本校历史上的一个重要的发展阶段，富有卓著的成就和优良的传统。殖民者在这里播下了“跳蚤”，却使中华民族收获了“龙种”。

清光绪十七年（1891年）：美以美教会福州年议会决定在福清设学。

清光绪十八年（1892年）：春季，美以美教会在融城租用民房设立培元书院。创办之初，学生16人，教工2人。籍贯为泉州惠安县鼎模村的方鲍参牧师任院长。

清光绪十九年（1893年）：修意牧师任监学。

清光绪二十年（1894年）：余修意接任院长。蒋学书接任监学。

清光绪二十一年（1895年）：修意牧师在海口堂与传教士李承恩商定后，报美以美教会福州年议会备案，在牛田（即龙田)借用教堂分设培元书院

清光绪二十二年（1896年）：消县城书院，全部师生合并于龙田。院长魏香谷，监学何调友。

清光绪二十四年（1898年）：方鲍参接任院长。

清光绪二十五年（1899年）：方鲍参院长继续兼任监学。

清光绪三十三年（1907年）：培元书院改名为融美中学堂。融美中学自兹确立于现址。

1949年：，中共福清县委在云中洋召开县委扩大会议决定成立南区区委会。6月10日，南区区委会贯彻县委扩大会议精神，在龙高地区建立7个工委会。本校校友施传福任龙田工委会主席。4月，部分学生参加攻打龙田张厝祠伪县保安中队救护工作，薛锡顺同学受枪伤。9月，废除解放前的训导制度，国民党党义课、公民课、军训、童子军训练等均予取消。12月，林贞瑞、张端机参加闽侯专署干部学校学习，1950年3月学习结业回校。是年，图书馆清点图书总数为1700册。是年，教务主任方景曾，事务主任薛永香。

1997年：评为“福建省推行《国家体育锻炼标准施行办法》先进单位”。

2005年：召开八届一次教代会，审议通过了《福清三中教师职务竞聘评价实施办法》等文件，选举产生了新一届工会委员会，陈绍辉任主席、陈云兴为副主席。

10月27日，中共福清市委宣传部以融委宣干[2005]36号通知，聘任余松为政教处主任，何城为政教处副主任，聘期三年；以融委宣干[2005]40号通知决定刘辉任团委副书记