南京大学化学与生物医药科学研究所成立于2011年5月， 由2004年诺贝尔化学奖获得者阿龙·切哈诺沃担任所长。研究所坐落于南京大学仙林校区，校内占有实验办公面积500平米。除此以外，在学校北面相邻的江苏省生命科学园，研究所拥有2000平米的实验办公用房。研究所周围风景优美，建筑规模宏大，科研设施先进，西邻九乡河湿地公园，东濒仙林湖，北望栖霞山景区，人文与自然环境得天独厚。

研究所现拥有世界先进的科研设施，国际的师资队伍，为南京大学建设为世界大学快马加鞭。在科研方面，研究所主要定位在分子医学、有机药物化学、分子和细胞生物学等基础上的跨学科研究，开发有关蛋白的化学生物学和分子医学的不对称催化剂，发展肽、类肽物、新颖镇痛剂及抗炎药。除此以外，研究所大力推进国内与国际工业合作，组织国际研讨会。