南京市城市与交通规划设计研究院有限责任公司前身为南京市交通规划研究所，创建于1996年，原为全民事业单位，隶属于南京市规划局，2004年改制转企为“南京市交通规划研究所有限责任公司”。2009年10月，公司正式更名为“南京市城市与交通规划设计研究院有限责任公司”。经过十几年发展，公司完成了由专门从事交通规划研究的单一研究机构向城市与交通的综合性规划设计与研究机构的转变。
公司目前拥有江苏省AAA级（高级别）信誉咨询企业（机构）资信等级称号；拥有城市规划编制乙级资质、公路、市政工程工程设计丙级资质。公司是江苏省首批博士后科研工作站、首批“江苏省民营科技企业”。
公司拥有一支由教授、研究员等具有较高知名度的高层次核心人才领衔，博士、硕士占80%以上构成的50人精英团队。团队中有教授及研究员级高级工程师（规划师）5名，有全国人大代表、新世纪“百千万人才”国家级人选、国家畅通工程组成员、国务院政府特贴、省“333”人才培养对象、省突出贡献中青年、南京市行业技术与学术带头人。
公司下设综合交通规划设计与城市规划设计4个业务所，综合管理部与技术市场部2个职能管理部门，产品线涵盖了城市、道路、交通、市政规划设计和研究等多领域，现已形成了规划、设计等业务协同发展的产品线优势。形成和具备了“队伍精干、思想活跃、理念先进、技术娴熟、成果、服务精良”的企业特色和品牌优势。
公司目前年营业收入超过4000万元，市场覆盖了江苏、浙江、北京、上海、山东、安徽、河北、河南、山西、广东、广西、西藏、内蒙等全国二十多个省市的50多个大中城市，具备了同时开展多项重大研究项目的生产能力。
十几年来，公司共完成了一大批有影响力的项目和研究成果，获得各类奖项70余项，其中国家及部省市科技进步奖20项、省级以上规划设计奖20余项。公司连续7年获得南京市道路交通综合整治有功单位，连续4年获得南京城市建设立功竞赛先进单位等荣誉称号。
2007年公司正式颁布了公司十年发展战略规划，明确了公司总体发展战略、业务、经营、职能发展战略，确立了“以客户为导向、视质量为生命、向管理要效益”的经营理念，“**、创新、严谨、务实”的企业精神和“民主包容、开放协作、学习敬业”的企业文化。
2009年10月，基于公司业务发展和战略定位需要，公司正式更名为“南京市城市与交通规划设计研究院有限责任公司”。更名后的公司将努力打造和提升更具竞争力的品牌优势、产品优势，更好地体现交通对城市发展的引领与互动，并为广大客户提供更加完善的产品和的规划设计服务。相信在公司董事会的正确领导下，在全体员工的共努力下，在各级领导、各界人士和广大客户一如既往的支持下，“南京市城市与交通规划设计研究院有限责任公司”将会是一朵绽放在全国规划设计领域中更加鲜艳的奇葩。