南京市第四十一中学是一所市属初级中学。学校始建于1962年，原名为南京市唐山路中学，后与中山桥中学合并，更名为南京市第四十一中学。1984年南京市政府决定恢复南京师范专科学校并设校址于此。为了支持师专办学，学校停办了高中，并于1985年更名为南京师范专科学校附属中学。因南京市教育布局调整，南京师范专科学校升格为南京晓庄学院。为沿袭历史，同时引入名校的优质教育资源，学校于2006年3月又更名为南京晓庄学院附属中学，并增挂南京市中学分校校牌。　　

多年来，在全面实施素质教育的过程中，学校坚持“德育为首、育人为先”的原则，积极开展“热爱祖国、热爱社会主义、热爱集体”的思想品德教育和行为习惯的养成教育，高度重视校园文化建设，经常开展丰富多彩的文化娱乐活动，充分利用宣传橱窗结合形势按专题定期张贴宣传图片、学生自编小报、卫生常识、学生事迹等，努力营造健康向上的文化氛围，陶冶学生的情操。由于德育工作卓有成效，2000年被评为是南京市“德育先进学校”。针对当代青少年心理发展的特点，学校积极开展心理健康教育，建立了心理咨询室，心理咨询活动规范有效，被江苏省心理学会心理发展委员会认定为“心理教育实验学校”，并被评为“心理教育先进集体”。在推进教育现代化和教育信息化的过程中，学校教学设施渐趋齐全，装备日趋先进，管理日臻完善。理、化、生实验室己跻身“市先进实验室”的行列。教育信息化的硬件和软件建设己初具规模。以宽带和互联网连接的千兆校园网、具月学校被省教育厅认定为“江苏省教育现代化工程示范初中”。　　

多年来，学校坚持“教学为中心”，不断完善教学质量监控制度和机制，扎扎实实抓教学，理直气壮抓质量。教学工作中坚持面对学生的实际，面向全体学生，关爱后进学生，不断实施教法改革和学法指导，千方百计的调动学生学习的积极性和主动性。在夯实基础的同时，努力探索综合应用能力和创新能力培养和训练的新途径。“一切为了学生，为了一切学生，为了学生的一切”己成为全校教职员工的行为准则。学校的教育教学质量有口皆碑，在下关地区有良好的知名度。