温州海洋职业学院性质为国有公办，根据海洋经济建设和社会发展的需求，拟设置水产养殖技术、水生动植物保护、航海技术、船舶工程、港口物流、海洋旅游、生物技术、绿色食品等专业，并根据产业发展和人才需求状况开设电子商务、市场营销、数字智能等专业。该学院以全日制学历教育为主，学制三年。同时，还将开展成人教育、短期培训、技术研发等项目，力图逐步发展成为融教学、培训、研发为一体的现代化职业院校。

2013年2月，平阳县与温州科技职业学院签订协议，启动合作共建温州海洋职业学院（又名温州科技职业学院平阳学院）事宜，计划培养更多技术技能型人才，尤其是涉海专业人才，并有望在本年度秋季招生。

目前，平阳县已于万全镇宋埠社区选定地块建设校园。校区占地面积1000亩，建成后可容纳8000-10000学生学习生活。平阳县作为学院投资方，为校园权属主体，负责土地的征用和校园基建工作；温州科技职业学院作为办学方，负责学校发展规划、专业建设、教师队伍建设、学校管理等办学工作。此外，为了尽早实现人才培育，校园未建设完毕等设置条件未成熟之前，平阳县将择定一所中职学校作为临时校园，由温州科技职业学院派员启动教学工作。